Strategien zur Auflösung von Kollisionen im parallelisierten Bindungs-Fluktuation-Modell

Methode: Computersimulation, Bindungs-Fluktuations-Modell

Während im klassischen Bindungs-Fluktuations-Modell (BFM) einzelne Monomere in zufälliger Reihenfolge nacheinander bewegt werden, wird in parallelisierten
Versionen des BFM versucht, möglichst viele Monomere gleichzeitig in zufällige Richtungen zu bewegen. Hierbei treten jedoch Konflikte (Kollisionen) zwischen
den einzelnen Bewegungen auf, welche grundlegende Eigenschaften des BFM verletzen.
Im Rahmen dieser Arbeit sollen Strategien zum Finden und Auflösen solcher Kollisionen für die Grafikkartenversion des BFM entwickelt, implementiert und optimiert
werden. Die Auswirkung dieser Strategien auf die Modelleigenschaften des BFM und die Performance sollen getestet werden.


Schlüsselwörter: Polymerkette, Parallelisierung, Monte Carlo Simulation, Bindungs-Fluktuations-Modell, Grafikkartenprogrammierung


Literatur: H. P. Deutsch and K. Binder, J. Chem. Phys. 94, 2294 (1991)

Kontakt

Verantwortlicher: Prof. Sommer

Tel: +49 351 4658 750
Fax: +49 351 4658 281
E-Mail: Sommer[at]ipfdd.de

 
Strategien zur Auflösung von Kollisionen im parallelisierten Bindungs-Fluktuation-Modell
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